Некоторое время меня мучала эта проблема. Симптом у неё примерно такой:

1 2 3

$ yaourt -S qutim-svn qutim-svn пакет не найден, поиск группы... ошибка: 'qutim-svn': не найден в базе данных

Если же я приписывал aur/ к имени пакета для прямого указания источника, то все срабатывало. Но это решение не очень удобно. Что я сделал для полного лечения:
Посмотрим, какие репозитории у нас есть в наличии:

Ага! Видим, что в списке есть несколько репозиториев, которые мы уже не используем. И в них был нужный пакет (в моем случае пакет qutim-svn был в dstr-repo и h31-repo). Pacman их тоже не использует, а вот Yaourt видит в них пакеты и считает, что pacman сможет их установить. Поэтому yaourt -S qutim-svn легким движением yaourt'а превращается в pacman -S qutim-svn, который и не срабатывает. Проблема эта решается легко и кардинально:

Вместо h31-repo подставляем нужную директорию.