Думал о том же буквально минуту назад. Что, в общем, неудивительно, так как эти мысли точат мой мозг с наступлением прошлой осени.
Смысл информации не только в данных, но и в доступности и актуальности. Недаром гугл двигает доксы и ридер, недаром есть дропбоксы и иксмарксы :)

Интерес к вопросу есть. Но тут дело не сколько в ядрах и баш-скриптах. Концепция нужна. Я пока что в блокноте (бумажном) ее рисую. Похвастаться сейчас нечем.

Возможно имеет смысл уже посли загрузки включать какие либо скрипты, которые бы выключали модули и тд. А так, как это сделать системными средствами - хз.

1. пишем скрипт синхронизации папки\файлов, еще чего-то

2. добавляем правило в udev для нужной флешки, в котором вызываем написанный скрипт:
ACTION=="add", SUBSYSTEM=="usb_device", SYSFS{idVendor}=="xxxx", SYSFS{idProduct}=="yyyy", RUN+="/path/to/script"

xxxx и yyyy получаем из lsusb
например, у меня
Bus 005 Device 005: ID 1307:0163 Transcend Information, Inc. 512MB USB Flash Drive
где xxxx = 1307 ; yyyy = 0163

возможно придется заменить "usb_device" на "usb" и SYSFS на ATTRS.