В GNOME На панели находится строка меню (Приложения, Переход, Система).
В меню "Переход" элементы Компьютер, Сеть открываются как нужно в nautilus,
остальные (закладки) в audacious.

Где прописать через что открывать?

ответил solomenikm --
Папка -> открыть с помощью -> руками вписываем "nautilus".

Audacious — универсальный свободный аудиопроигрыватель, похожий на WinAmp, являющийся форком плеера Beep Media Player 0.9.7.1, который в свою очередь является форком XMMS. В последнее время разработчики сосредоточились на допиливании кода, поэтому резких изменений ждать не стоит. Тем не менее в новой версии:

Недавно, на досуге, то ли от нечего делать, то ли от лени постоянно Драг'н'Дропать файлы в плейлист Audacious решил написать простенький скриптик на питоне для добавления файлов в плейлист и добавить его в контекстное меню Наутилуса. И решил, почему бы не поделиться им с общественностью?