Открываем настройки rekonq на вкладке "вкладки" и снимаем галочки с "Открывать ссылки в новой вкладке, а не в новом окне" и "Всегда показывать панель вкладок":
Выставляем хоткеи Ctrl+t на "Открыть новое окно" и Ctrl+w на "Выход":
Жмём правой кнопкой на заголовок окна, настроить поведение окон
Выбираем вкладку "Особые параметры окон" и создаём новое правило:
Жмём "Определить свойства окна" и тыкаем на окно с rekonq
Ставим галочку "Использовать класс окна (всё приложение)":
Переходим на вкладку "Поведение", выставляем "Автогруппировка с идентичным" - "принудительно" и ставим галочку:
Наслаждаемся результатом =)
PS работает с kde 4.4 и rekonq 0.5 и git
И под конец, сравнение размера верхней панели в популярных браузерах: