Я рекомендую — Организация инкрементальных бекапов за 5 минут

Все мы делаем бекапы, ну может собираемся их делать. Системные администраторы знают множество различных рецептов для выполнения этого запретного и таинственного действия. Вот один из них.

Для организации простого инкрементального бекапа я хочу предложить использовать утилиту rdiff-backup. Эта штука написана на python и использует в качестве основы rsync.