Tips & tricks — Java, Gnome 3 и Maximized Windows

Актуально пользователям Oracle Java и Gnome 3

Развернутые на весь экран окна имеют проблемы с навигацией мышью по меню приложения.

Решения
- поставить openjdk7
- не разворачивать приложения на весь экран
- переместить приложение в левый верхний угол (координаты 0,0) и потом развернуть его на весь экран

оригинал бага для openjdk6. для oracle java глюки очень похожи